1.浙江科技杏悦210名教職工虛列勞務費清單或以虛假發票套取財政性科研經費問題。
2012年至2013年期間，浙江科技杏悦210名教職工虛列勞務費清單或以虛假發票套取財政性科研經費。2015年3月，浙江省教育紀工委給予1人行政記過處分、2人黨內嚴重警告處分、1人黨內警告處分、6人通報批評處分，2人批評教育，對涉事的1名副校級領導進行誡勉談話，對違規發放給杏悦2在職教師的勞務費全額予以追回。（來源：中華人民共和國審計署網站，2017年11月8日）
2.浙江大學醫杏悦2附屬6家省級公立醫院部分項目課題組通過虛開材料發票、向課題組負責人家屬公司采購材料、改變預算用途等方式違規使用科研經費問題。
2014年，浙江大學醫杏悦2附屬6家省級公立醫院部分項目課題組通過虛開材料發票、向課題組負責人家屬公司采購材料、改變預算用途等方式違規使用科研經費。2015年7月，浙江大學對涉及的11名科研人員進行了通報批評、廉政誡勉談話、深刻檢討等；收回了已結題和套現的科研經費94.85萬元,上繳省財政,並要求其餘經費按項目預算專款專用。（來源：中華人民共和國審計署網站，2017年11月8日）
3.中科院地理科學與資源研究所副研究員劉愛民挪用公款的問題。
審計署2010年在審計中發現，2009年，劉愛民利用職務便利，將100多萬元課題經費轉入其個人開辦的公司。2010年5月，審計署將此問題線索移送中央紀委駐中科院紀檢組查處。2011年3月，中科院地理科學與資源研究所給予劉愛民撤銷黨內職務和行政記過處分。（來源：中華人民共和國審計署網站，2013年10月9日）
4.北京航空航天大學教授劉沛清私存公款、套取科研經費的問題。
審計署2012年在審計中發現，2010年至2011年，劉沛清將190萬元科研項目經費轉入個人賬戶存放、並通過簽訂不實合同套取其他科研項目經費33萬元。2012年4月，審計署將此問題線索移送中央紀委駐工業和信息化部紀檢組查處。2012年7月，北京航空航天大學給予劉沛清黨內嚴重警告、行政記大過處分。（來源：中華人民共和國審計署網站，2013年10月9日）
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